私が以前パッチを書いて報告していた SML/NJのCygwin上でのインストールに失敗するバグ が 110.77(08/22/14) で修正されています。

Here is a list of tracked bugs fixed (or closed) with this release, please see the bug tracker for more details.
125 build script is broken on Cygwin-x86


Older versions of Cygwin had a file /usr/include/exceptions.h, but this
file has disappeared in more recent versions. Here is the key bits
taken from

やっぱり古いCygwinでは exceptions.h が存在したようなんですが、Cygwinはどれが本家のソースコードかよく分からないんですよねぇ(^^;;